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Aggregazione di risorse GATK

L’aggregazione di risorse GATK è una raccolta di file standard per l'uso dei dati di risequenziamento umano con GATK.

Nota

Microsoft fornisce i set di dati aperti di Azure così come sono e non fornisce né garanzie, esplicite o implicite, né specifica alcuna condizione in relazione all'uso dei set di dati. Nella misura consentita dalla legge locale, Microsoft declina tutte le responsabilità per eventuali danni o perdite, incluse dirette, consequenziali, speciali, indirette, accidentali o irreversibili, risultanti dall'uso dei set di dati.

Questo set di dati viene fornito in conformità con le condizioni originali in base alle quali Microsoft ha ricevuto i dati di origine. Il set di dati potrebbe includere dati provenienti da Microsoft.

Origine dati

Questo set di dati è un mirror dell'archivio dati in https://gatk.broadinstitute.org/hc/articles/360035890811-Resource-bundle

Volumi di dati e frequenza di aggiornamento

  1. datasetgatkbestpractices : 542 GB
  2. datasetgatklegacybundles: 61 GB
  3. datasetgatktestdata: 2 TB
  4. datasetpublicbroadref : 477 GB
  5. datasetbroadpublic: 3 TB

I set di dati vengono aggiornati ogni mese durante la prima settimana del mese.

Posizione di archiviazione

Questo set di dati è archiviato nelle aree di Azure Stati Uniti occidentali 2 e Stati Uniti centro-occidentali. L'allocazione delle risorse di calcolo nell'area Stati Uniti occidentali 2 o Stati Uniti centro-occidentali è consigliata per motivi di affinità.

Accesso ai dati

  1. datasetgatkbestpractices

    Stati Uniti occidentali 2: 'https://datasetgatkbestpractices.blob.core.windows.net/dataset'

    Stati Uniti centro-occidentali: 'https://datasetgatkbestpractices-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

  2. datasetgatklegacybundles

    Stati Uniti occidentali 2: 'https://datasetgatklegacybundles.blob.core.windows.net/dataset'

    Stati Uniti centro-occidentali: 'https://datasetgatklegacybundles-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

  3. datasetgatktestdata

    Stati Uniti occidentali 2: 'https://datasetgatktestdata.blob.core.windows.net/dataset'

    Stati Uniti centro-occidentali: 'https://datasetgatktestdata-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

  4. datasetpublicbroadref

    Stati Uniti occidentali 2: 'https://datasetpublicbroadref.blob.core.windows.net/dataset'

    Stati Uniti centro-occidentali: 'https://datasetpublicbroadref-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

    Stati Uniti centro-meridionali: 'https://datasetpublicbroadrefsc.blob.core.windows.net/dataset'

  5. datasetbroadpublic

    Stati Uniti occidentali 2: 'https://datasetbroadpublic.blob.core.windows.net/dataset'

    Stati Uniti centro-occidentali: 'https://datasetbroadpublic-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

    Stati Uniti centro-meridionali: 'https://datasetbroadpublicsc.blob.core.windows.net/dataset'

Condizioni per l'utilizzo

Visitare il sito ufficiale dell’aggregazione di risorse GATK.

Contatto

Visitare il sito ufficiale dell’aggregazione di risorse GATK.

Passaggi successivi

Visualizzare il resto dei set di dati nel catalogo dei set di dati aperti.