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Observação

Atualização importante de 19/09/2024: todas as URLs estão mudando. Estamos habilitando o acesso público a todos os contêineres do Genomics Data Lake. As "URLs assinadas" existentes (assinaturas de acesso compartilhado) serão desativadas em: 2024-11-04T00:00:00Z. Após esse tempo, as URLs sem uma cadeia de caracteres de consulta continuarão funcionando, no entanto, as "URLs assinadas" não funcionarão mais e retornarão um código de status HTTP 403. Planeje de acordo para acessar as URLs públicas sem uma cadeia de caracteres de consulta após essa data (remova os caracteres '?' e os caracteres à direita).

A Plataforma de Open Targets é um recurso de dados para facilitar a identificação sistemática e a priorização de possíveis destinos de medicamentos terapêuticos. Esse recurso integra conjuntos de dados publicamente disponíveis, incluindo os conjuntos de dados gerados pelo consórcio Open Targets, para criar e pontuar associações de doenças de destino, auxiliando na identificação e priorização de destinos de medicamentos. Além disso, incorpora informações de anotação pertinentes sobre destinos, doenças, fenótipos, medicamentos e suas relações-chave.

A Open Targets Genetics destaca evidências estatísticas centradas em variantes para permitir tanto a priorização de variantes causais candidatas em loci associadas à característica quanto a identificação de potenciais destinos de drogas. Coleta e combina associações genéticas coletadas da literatura publicada, bem como dados recém-derivados de fontes como o UK Biobank e o FinnGen. Além disso, inclui informações de genômica funcional, como conformidade e interações de cromatina, juntamente com loci de característica quantitativa (eQTLs, pQTLs e sQTLs). Os pipelines em grande escala aplicam o mapeamento estatístico fino entre milhares de loci associados a características para resolver sinais de associação e vincular cada variante aos seus genes de destino proximal e distal usando uma avaliação "Locus2Gene". Análises integradas de colocalização entre características e vinculação a compostos farmacêuticos detalhados estendem a capacidade da Open Targets Genetics de explorar oportunidades de repositório de medicamentos e arquitetura genética compartilhada.

Observação

A Microsoft fornece o Azure Open Datasets no estado em que se encontra. A Microsoft não oferece garantias nem coberturas, expressas ou implícitas, em relação ao uso dos conjuntos de dados. Até o limite permitido pela legislação local, a Microsoft se exime de toda a obrigação por danos ou perdas, inclusive diretos, consequentes, especiais, indiretos, acidentais ou punitivos, resultantes do uso dos conjuntos de dados.

Esse conjunto de dados é fornecido de acordo com os termos originais com que a Microsoft recebeu os dados de origem. O conjunto de dados pode incluir dados originados da Microsoft.

Fonte de dados

Esse conjunto de dados é um espelho de http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/platform/latest e http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/opentargets/genetics/latest/

Volumes de dados e frequência de atualização

Este conjunto de dados contém aproximadamente 350 GB de dados e é atualizado diariamente.

Local de armazenamento

Esse conjunto de dados está armazenado na região Leste dos EUA 2 do Azure. É recomendável alocar recursos de computação na região Leste dos EUA 2 para fins de afinidade.

Acesso de dados

Oeste dos EUA 2: https://datasetopentargets.blob.core.windows.net/dataset

Token SAS: sv=2019-10-10&si=prod&sr=c&sig=9nzcxaQn0NprMPlSh4RhFQHcXedLQIcFgbERiooHEqM%3D

Termos de uso

Consulte os termos de uso de dados, conforme descrito aqui.

Contato

https://www.internationalgenome.org/contact

Visualize o restante dos conjuntos de dados no Catálogo do Conjunto de Dados em Aberto no Azure.