Freigeben über

Überblick über die DICOM-Datentransformation in Datenlösungen für das Gesundheitswesen

  • Artikel

Die Funktion DICOM-Datentransformation in Datenlösungen für das Gesundheitswesen ermöglicht es Ihnen, DICOM-Daten (Digital Imaging and Communications in Medicine) in Fabric OneLake zu übernehmen. Sie können Bildmetadaten aus verschiedenen Modalitäten wie Röntgenstrahlen, Computertomografie (CT) und Magnetresonanztomografie (MRT) erfassen, speichern und analysieren. Die Funktion ermöglicht Zusammenarbeit, Forschung und Entwicklung (F&E) sowie KI-Innovationen für verschiedene Anwendungsfälle im Gesundheitswesen und in den Biowissenschaften. Die Integration zwischen Bilddaten und klinischen Daten, die im FHIR-Format (Fast Health Interoperability Resources) gespeichert sind, ermöglicht es Ärzten und Forschern, Bildgebungsbefunde im richtigen klinischen Kontext zu interpretieren. Diese Interpretation führt zu einer höheren Genauigkeit in der Diagnose, auf Informationen gestützte klinische Entscheidungen und verbesserte Patientenergebnisse.

Die Pipelines für Datenlösungen für das Gesundheitswesen ermöglichen die nahtlose Transformation von DICOM (Bildgebungs)-Daten in tabellarische Formate, die in den Formaten FHIR (Silver) und OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) (Gold) im Lake verbleiben können. Sie erleichtern die Durchführung umfangreicher Analysen und bildgebender Analysen und Radiomics. Die Datentransformation durch die Bildgebungs-Erfassungspipeline besteht aus den folgenden Phasen:

  1. Die Pipeline erfasst und speichert die DICOM-Dateien, die im nativen DCM-Format vorliegen, im Bronze Lakehouse.
  2. Anschließend extrahiert sie die DICOM-Metadaten (Tags) aus den Bilddateien und fügt sie zur einfachen Abfrage in den DICOM-Metastore von Bronze Lakehouse ein.
  3. Die Daten im DICOM Metastore werden in FHIR ImagingStudy Deltatabellen-NDJOSON-Dateien konvertiert, in OneLake gespeichert und in das relationale FHIR-Format (Silver Lakehouse) transformiert.
  4. Abschließend werden die Daten in die Delta-Tabelle Image_Occurrence im OMOP-Format (Gold Lakehouse) transformiert.

Diese Transformation erleichtert Szenarien wie:

  • Freigabe von Forschungsdatensets mit rollenbasierter Zugriffssteuerung
  • Anonymisierung von Text- und Bilddaten für Forschung und Zusammenarbeit
  • Verwenden von DICOM-Daten zum Trainieren und Validieren von Machine Learning-Modellen
  • Verwenden von DICOM-Daten für die Durchführung klinischer Studien, epidemiologischer Analysen und Bildungsaktivitäten

Die DICOM-Datentransformation ist eine optionale Funktion in Datenlösungen für das Gesundheitswesen in Microsoft Fabric. Sie haben die Flexibilität zu entscheiden, ob Sie es verwenden möchten oder nicht, abhängig von Ihren spezifischen Anforderungen oder Szenarien.

Informationen zu dieser Funktion sowie zur Bereitstellung, Konfiguration und Verwendung finden Sie unter:

Konzeptionelle Architektur

Wie in Datenarchitektur und -Management in Datenlösungen für das Gesundheitswesen erklärt, liegt der Funktion die Medaillon-Lakehouse-Architektur zugrunde. Dieses Framework organisiert und verarbeitet DICOM-Daten wie folgt auf den drei Lakehouse-Ebenen:

  • Bronze: Diese erste Schicht speichert die Quellbilddaten in ihrem ursprünglichen DICOM-Format (DCM-Dateien) und einem Metastore, der den vollständigen Satz von Metadaten (DICOM-Tags) enthält, die aus den DCM-Dateien extrahiert werden.

  • Silver: Die Silver-Ebene (basierend auf der FHIR-Spezifikation) speichert die Bildmetadaten, die aus dem Bronze Lakehouse erfasst werden. Außerdem werden referenzielle Dateiverknüpfungen zu den Speicherorten der DCM-Datei in der Bronze-Schicht gespeichert. Die Bildmetadaten und Dateiverweise werden in der Delta-Tabelle ImagingStudy gespeichert, deren Schema auf einem vereinfachten Format der ImagingStudy-FHIR-Ressource (R4.3) basiert.

  • Gold: Das goldene Ebene (basierend auf der OMOP Spezifikation) speichert und transformiert Bilddaten aus der silbernen Lakehouse ImagingStudy Delta-Tabelle. Die Bildmetadaten und Dateireferenzen werden in der Delta-Tabelle Image_Occurrence auf der Gold-Ebene gespeichert, deren Schema auf den neuesten Entwicklungen der Datenstandardisierung für die bildgebende Beobachtungsforschung basiert. Weitere Informationen zu dieser Standardisierung finden Sie unter OMOP Common Data Model Extension für medizinische Bilddaten.

Um zu verstehen, wie die DICOM-Metadaten zwischen verschiedenen Lakehouses transformiert werden, und um die Transformation Zuordnung zu überprüfen, (siehe DICOM-Metadatentransformation Zuordnung in Datenlösungen für das Gesundheitswesen.