Visão geral de Transformações OMOP nas soluções de dados de serviços de saúde
O objetivo da implementação de qualquer Common Data Model é estabelecer padronização e agilizar a estruturação, armazenamento, compartilhamento, troca e uso de dados. Nas soluções de dados de serviços de saúde, você pode usar transformações OMOP para implantar o OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) CDM (Common Data Model) no ambiente do lakehouse do Fabric. Essa implantação fornece aos pesquisadores da comunidade OMOP acesso à escala expansiva do OneLake e aos recursos de IA da plataforma Fabric. A configuração permite a execução eficiente e confiável de análises padronizadas para estudos observacionais em nível de paciente e população.
Ao implantar o OMOP CDM no Fabric usando pipelines predefinidos, você pode usar os notebooks fornecidos para construir modelos estatísticos, conduzir estudos de distribuição populacional e utilizar relatórios do Power BI para comparar visualmente várias intervenções e seus efeitos nos resultados dos pacientes. Essas capacidades analíticas permitem que os pesquisadores realizem análises comparativas, como avaliar procedimentos e exposições a drogas ou examinar correlações entre exposições a drogas e ocorrências de condições. Para referência e orientações, o recurso também fornece notebooks de exemplo para esses cenários.
Transformações OMOP são um recurso opcional em soluções de dados de serviços de saúde no Microsoft Fabric. Você tem a flexibilidade de decidir se deseja usá-lo ou não, dependendo de suas necessidades ou cenários específicos.
Para saber como implantar, configurar e usar o recurso Transformações OMOP, consulte:
- Implantar e configurar transformações OMOP
- Usar transformações OMOP
- Usar notebooks de exemplo de transformações OMOP
Depois de transformar seus dados no modelo OMOP, você também pode consultar e analisar os dados usando o recurso Descobrir e criar coortes (versão preliminar) nas soluções de dados de serviços de saúde.
O que está incluído no OMOP CDM
As soluções de dados de serviços de saúde no Microsoft Fabric implementam o OMOP Common Data Model versão v5.4 com foco no mapeamento de recursos clínicos FHIR (Fast Healthcare Interoperability Resources) para tabelas OMOP correspondentes no Fabric. O esquema completo de OMOP CDM com todas as suas tabelas é preenchido no lakehouse healthcare#_msft_gold_omop. No entanto, somente as tabelas clínicas são mapeadas para os recursos FHIR.
As tabelas em Economia da saúde padronizada estão fora do escopo e não são mapeadas para nenhum recurso FHIR. Elas não serão preenchidas depois que os pipelines de transformação forem executados do lakehouse healthcare#_msft_silver para o lakehouse healthcare#_msft_gold_omop.
Incluímos vocabulários padronizados para mapear terminologias e códigos dos recursos clínicos FHIR para conceitos padrão OMOP correspondentes no domínio clínico.
O Conjunto de Dados do Athena contém referências a vocabulários específicos do domínio.
Os vocabulários padrão incluídos na versão atual são SNOMED-CT (Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms), LOINC (Logical Observation Identifiers, Names, and Codes) e RxNorm.
